ENSA se constituye como una Sociedad Mercantil Estatal unipersonal que tiene como accionista mayoritario a la SEPI, cuya contratación se ajusta a sus instrucciones internas de contratación, y cuyo presupuesto anual se integra en el presupuesto consolidado del Grupo SEPI, formando parte de los Presupuestos Generales del Estado.

ENSA no está obligada a presentar de forma individualizada su presupuesto, según el artículo 66 de la Ley 47/03 General Presupuestaria.